Im Zusammenhang mit dem Sofortprogramm Seehafen-Hinterlandverkehr wird der Bahnhof Nürnberg-Stein im Jahr 2011 nochmals einen Umbau erleben. Es soll der Bahnsteig am Gleis 5 in Stein ebenfalls auf S-Bahnstandard umgebaut werden. Außerdem sind umbauten bei einigen Weichen geplant. Dadurch ist es dann möglich, das Züge aus Nürnberg Hbf kommend nach Gleis 5 einfahren, während gleichzeitig Güterzüge von und nach Ansbach ein- und ausfahren können. Durch diese maßnahmen soll die Zugfolge auf der Strecke weiter Optimiert werden. Inzwischen ist in den Baustelleninformationen von DB Netz auch ein Termin für den Umbau zu finden. Im Zeitraum vom 28.2.2011 bis 15.6.2011 bleibt das Gleis 5 in Stein aufgrund der Bauarbeiten gesperrt.